Если иностранная организация (не состоящая на учёте в налоговых органах РФ) в стоимости услуг по установке распределительного центра (логистического оборудования) не учитывает сумму НДС, подлежащую уплате в бюджет РФ, тогда российская организация должна уплачивать налог в бюджет за счет собственных средств. Налог при этом уплачивается в тех налоговых периодах, в которых производится перечисление денежных средств иностранному лицу. К такому выводу пришёл Минфин в своём письме от 20.07.2006 № 03-04-08/156.
Поскольку местом реализации оказываемых иностранной фирмой услуг по установке распределительного центра является территория России, то согласно пп. 1 п. 1 статьи 146 Налогового кодекса (НК) такая операция подпадает под уплату НДС. Налог в этом случае уплачивается в бюджет налоговым агентом, приобретающим данные услуги у иностранного лица (п.1, п.2 статья 161 НК).