Суммы купонного дохода, поступившие на специальный счет депозитария, с которых банк (депозитарий) при перечислении дохода на спецброкерский счет удержал исчисленную сумму налога на доходы физических лиц, учитываются при определении налоговой базы по операциям банка в рамках договора на брокерское обслуживание с зачетом суммы налога, удержанного при перечислении купонного дохода на спецброкерский счет.
Об этом Письмо Минфина России от 21.08.2012 N 03-04-06/4-254.
В соответствии с п. 18 ст. 214.1 Налогового кодекса Российской Федерации (далее - Кодекс) налоговая база по операциям с ценными бумагами, по операциям с финансовыми инструментами срочных сделок, по операциям РЕПО с ценными бумагами и по операциям займа ценными бумагами определяется налоговым агентом, при этом налоговым агентом в целях данной статьи признается, в частности, депозитарий, осуществляющий выплату (перечисление) дохода в денежной форме по федеральным государственным эмиссионным ценным бумагам с обязательным централизованным хранением независимо от даты регистрации их выпуска, а также по иным эмиссионным ценным бумагам с обязательным централизованным хранением (в отношении выпусков, государственная регистрация которых или присвоение идентификационного номера которым осуществлены после 1 января 2012 г.) владельцу таких ценных бумаг.
Из вышеприведенной нормы ст. 214.1 Кодекса следует, что депозитарий при выплате (перечислении) дохода по вышеуказанным ценным бумагам самостоятельно выполняет функции налогового агента.
С учетом изложенного депозитарий при перечислении по распоряжению клиента сумм купонного дохода по ценным бумагам с обязательным централизованным хранением на спецброкерский счет должен исчислить и удержать с этих сумм налог на доходы физических лиц с направлением в налоговый орган в установленном порядке сведений о выплаченных доходах по форме 2-НДФЛ .
В соответствии с абз. 2 п. 7 ст. 214.1 Кодекса доходы в виде процента (купона, дисконта), полученные в налоговом периоде по ценным бумагам, включаются в доходы по операциям с ценными бумагами, если иное не предусмотрено данной статьей.
В соответствии с пп. 1 п. 10 ст. 214.1 Кодекса суммы купона, уплачиваемые в соответствии с договором купли-продажи ценных бумаг (в том числе ценных бумаг, по которым производились выплаты купонного дохода на счет депозитария), учитываются налоговым агентом в составе расходов по операциям с ценными бумагами в рамках договора на брокерское обслуживание.
Суммы, полученные в погашение номинальной стоимости ценных бумаг с обязательным централизованным хранением, в отношении которых депозитарий в соответствии с п. 18 ст. 214.1 Кодекса не признается налоговым агентом, подлежат в соответствии с п. 7 ст. 214.1 Кодекса включению налоговым агентом в доходы по операциям с ценными бумагами в рамках договора на брокерское обслуживание.